Molekylær Biomedicin B - Molekylær Biologi Kapitel 17 SDU

Målsætningsbesvarelser til Molekylær Biomedicin B SDU - Molekylær Biologi på SDU medicinstudiets bachelordel 1. semester.

Lærebog: TM Devlin: Textbook of Biochemistry... 5th edition.
Link til forum om biokemibøger på StudMed.dk - Biokemi

Kapitel 17

1. Forklare ribosomets funktion. Kort beskrive dets struktur som store rRNA-protein komplekser opbygget af to subunits i alle organismer.

2. Angive ribosomets tre sites for tRNA (A, amino; P, peptide; og E, exit site). Definere funktionen af disse tre sites.

3. Beskrive at rRNA’er udgør fundamentale bestanddele af ribosomet samt angive deres distribuering:

Prokaryote celler:	Eukaryote celler:
5S + 23S rRNA (50S subunit)	16S rRNA (30S subunit)
5S + 5.8S + 28S rRNA (60S subunit)	18S rRNA (40S subunit)

4. Angive at den genetiske kode består af 64 tri-nukleotid kodons (61 svarende til aminosyrer samt 3 stopkodons). Angive at der er undtagelser fra denne næsten universelle kode i mitokondrier. Genkende start og stop codons.

5. Definere begrebet ”reading frame” for mRNA. Angive at mRNA altid læses fra 5´→3´.

6. Angive at kodons i mRNA er komplementære til (og læses af) anticodons i tRNA.

7. Definere begrebet ”wobble hypotese” (kodons degenereret i 3. position). Beskrive hvorfor dette er særlig vigtigt i mitokondrier.

8. Beskrive monocistrone (eukaryot) og polycistrone (prokaryot) mRNA’er.

9. Beskrive hvordan tRNA aminoacyleres (charges) i 3´-enden med en aminosyre, herunder hvordan følgende elementer indgår i processen: Korrekt (cognate) tRNA, aminosyre, aminoacyl-tRNA syntetase og ATP.

10. Definere begrebet proofreading samt beskrive denne proces på syntetase enzymet.

11. Kort beskrive de tre faser af translationen: Initiering, elongering og terminering, samt angive at der under alle disse faser forbruges energi i form af GTP.

12. Beskrive kort initiering af translation ud fra følgende:

Prokaryote celler:
- Ribosom positioneringssekvens (Shine-Delgarno)
- AUG startkodon i mRNA
- 30S ribosomal subunit
- Initieringsfaktorer (tre proteiner)
- fMet-tRNA (i P-sitet)
Eukaryote celler:
- Første AUG fra 5´-CAP enden af mRNA er startkodon
- 40S ribosomal subunit
- Initierings faktorer (mange proteiner)
- Met-tRNA (i P-sitet)

13. Kort beskrive elongeringsfasen ud fra følgende:

Prokaryote celler:
- 50S ribosomal subunit samles med 30S (= 70S ribosom)
- Elongeringsfaktorer
- Korrekt (cognate) ladet tRNA (i A-sitet)
Eukaryote celler:
- 60S ribosomal subunit samles med 40S (=80S ribosom)
- Elongeringsfaktorer (EF-1αog EF-2)
- Korrekt (cognate) ladet tRNA (i A-sitet)

Peptidyl transferase aktivitet (peptid binding)
Translokation
Frigivelse af brugte (deacetylerede) tRNA’er gennem E-sitet

14. Beskrive termineringsfasen (stopkodon i A-sitet + releasefaktorer).

15. Beskrive hvordan mutationer kan resultere i ukorrekte proteinstrukturer.

16. Beskrive hvordan translationen kan hæmmes i bakterier af antibiotika og i eukaryote celler af toxiner.

17. Forklare hvorfor proteinsyntesen foregår lidt anderledes i mitokondrier.

18. Angive at proteiner syntetiseres i retningen N mod C og at de kan modificeres og udskilles post-translationelt.

19. Give eksempler på hvordan translationsprocessen kan reguleres.